一括登録ファイルを入力後、上書保存したのですが見つかりません。

Excelを再度起動し、「ファイル＞上書き保存」とすると前回保存したフォルダが指定されておりますのでこちらのフォルダをご確認ください。
それでも見つからない場合は、再度作成いただき、ご登録をお願いします。